科学家本（Zach Galifianakis 饰）隶属于美国政府一个秘密部门，他通过高科技手段训练豚鼠说话、思考，并将它们培养成精英特工。然而，本所在的部门面临被FBI关闭的危机，为了证明豚鼠特工的价值，他必须带领它们完成一次重大任务。此时，邪恶的亿万富翁麦肯锡正密谋利用智能家电产品控制全球消费者的生活，进而实施犯罪计划。豚鼠特攻队——包括队长达尔文、敢死队员布拉斯特、功夫高手华虎、电脑专家斯派克和嗅觉敏锐的佩内洛普——奉命潜入麦肯锡的工厂，展开秘密调查。在执行任务过程中，特攻队遭遇重重险阻，不仅要躲避安保系统，还要应对内部矛盾。但在队长达尔文的带领下，它们团结协作，利用各自的特殊技能，最终发现麦肯锡的阴谋并成功将其阻止。影片融合了幽默、动作与温情，展现了小动物们的大英雄气概，也证明了即使最微小的生命也能创造伟大的奇迹。