故事以雷克斯·路瑟的独白开篇，他冷眼审视着超人在世人眼中的神祇形象，却坚信“该来的时候，即使是神也必须要死”。与此同时，超人正享受着与露易丝·莲恩的浪漫约会，两人感情渐入佳境，但危机已悄然潜伏。莱克斯·卢瑟利用氪星科技与佐德将军的遗骸，秘密制造出名为“毁灭日”的生物兵器。这个怪物拥有无限再生能力，且越战越强，连超人的热视线和超级力量也难以将其彻底摧毁。毁灭日首次现身便引发城市恐慌，超人紧急出动，却发现自己面对的是一个无法用常规手段击败的对手。战斗中，毁灭日展现出惊人的破坏力，不仅重创超人，更将战场蔓延至整个大都会。超人多次尝试将其引入太空或深海，但毁灭日总能追踪并反击。露易丝在报道过程中发现卢瑟的阴谋线索，试图提醒超人，却为时已晚。最终，超人与毁灭日展开殊死搏斗，两人从城市打到荒原。在筋疲力尽之际，超人选择用仅存的力气将毁灭日拖入太空，以同归于尽的方式终结这场浩劫。地球恢复了和平，但超人却因耗尽生命而陨落。露易丝与全世界为他哀悼，而雷克斯·路瑟的预言最终成真——神确实死了，但他的牺牲将永远铭刻在人类心中。