故事发生在汇聚英才的私立汐美学园，这里有一座宏伟的图书馆，被学生们称为“睿智之城”。然而，在图书馆最深处的阅览室中，一场不为人知的命运邂逅悄然展开。主人公筧京太郎是一位内向且喜欢读书的少年，某天，他收到一条神秘的短信，预告了即将发生的意外。随后，他遇见了天真烂漫的牧羊人少女白崎鸫、活泼开朗的樱庭玉藻、冷静理性的御园千莉、温柔体贴的铃木佳奈，以及神秘寡言的嬉野纱纱。五名少女与京太郎因“牧羊人”的传说而聚集，她们各自怀揣着不同的烦恼与梦想。随着调查的深入，他们发现图书馆中隐藏着一台能够预测未来的装置，而“牧羊人”正是引导人们走向幸福的存在。然而，每一次选择都伴随着代价，少女们必须在个人愿望与集体利益之间做出抉择。故事通过细腻的情感描写和层层递进的悬念，探讨了“幸福”的真正含义，以及人与人之间羁绊的力量。最终，京太郎与伙伴们共同面对挑战，书写属于他们的青春篇章。